S Commander Keen se vrátíte do mladých let, protože Váš hlavní hrdina je v tomto případě osmiletý kluk jménem Keen. Tento chlapec si žije normálním dětským životem až do dne, kdy zjistí, že mimozemšťané chystají útok na planetu Zemi s cílem ovládnout ji. Vzhledem k tomu, že Keen prokoukl jejich lstivý plán, unesou ho a vysadí na cizí planetě. To si však Keen nenechá líbit a Vy jeho prostřednictvím můžete dát mimozemšťanům najevo, zač je toho loket. Commander Keen ve Vás rozhodně vyvolá tu starou, známou závislost na hře, kdy se nemůžete odtrhnout a level za levelem stále postupujete dál. Napínavý příběh se rozvíjí všemi díly Commander Keen a přímo na sebe navazuje, i proto je tento kompletní balíček všech her velkou výhodou. Nemusíte čekat, kdy mimozemšťani udeří, zkrátka jen zapnete další díl a překvapíte je Vy sami. (Přidal: Xzone)