The Legend of Zelda: Phantom Hourglass je víceméně přímým pokračováním kontroverzního Gamecube titulu The Legend of Zelda: The Wind Waker. Příběh Zeldy DS se odehrává několik měsíců po skončení Wind Wakera, kdy se Link společně s Tetrou a její pirátskou bandou plaví po mořích s cílem nacházet a prozkoumávat nové země. Jednou tak při plavbě narazí na kus oceánu, který je komplet zahalen v takřka neprostupné mlze, v níž narazí na opuštěnou loď. Tetra se osamotě vydá loď prozkoumat, ale potká ji nehoda a když se jí Link snaží zachránit, tak spadne do vody. Link se pak probere až na pobřeží tajemného ostrova, když jej z bezvědomí probere hlas víly, která mu bude pomáhat při průzkumu ostrova a hledání Tetry i cesty zpět na známé moře. Víceméně všechny Linkovi aktivity v The Legend of Zelda: Phantom Hourglass se dají ovládat pomocí stylusu, což platí hlavně o navigaci Linka lokacemi, máchání zbraní, komunikaci s postavami, určování trasy lodi, manipulaci s mapou, nebo kreslení dráhy letu pro bumerang. Když hráč stylusem ťukne na nějaké místo, tak se tam Link přesune. Máchavým pohybem v blízkosti Linka jej pak hráč přinutí k bojovým manévrům. Bude-li chtít hráč, aby si Link prohlédl předmět, či objekt, nebo se dal do rozhovoru s postavou, tak na ni opět stačí pouze ťuknout. S pomocí stylus bude hráč, respektive Link řešit i rozličné hádanky. Mapa je primárně zobrazena na horním displayi, zatímco Linka v akci hráč sleduje na displayi spodním. Hráč však může kdykoli mapu přivolat na spodní display a s pomocí stylus si do ní d... (Zobrazit celý text)